张锋再造三合一一组抗病毒的新型CRISPR Cas13系统

近日，麻省理工学院和哈佛大学Broad数据分析所传来盼望：Pardis C. Sabeti、张锋等科学家技术开发借助于一种新型的抗菌株系统对。世界上有许多少用的致命官能病原都是基于脱氧丝氨酸RNA的菌株，也许波拉菌株、山下菲利菌株和菌株。该系统对在CRISPR Cas13技术的思路随即升级，可用于监测和破坏人类文明细胞膜当中具脱氧丝氨酸RNA的菌株。该数据分析发表在《Molecular Cell》华尔街日报上。CRISPR系统对为抗菌株方法带来曙光早先，张锋小组的数据分析执法人员凭借着CRISPR/Cas9系统对为加固特异官能对抵抗菌株吞并带来原先希望。然而，吞并人类文明的菌株极为多变，即使是在同一亚种内，也能不断充分利用环境。因此我们需要更为灵活的公共卫生菌株和平台。为了探险原先抗菌株策略，数据分析执法人员将目光投向了CRISPR Cas13系统对，Cas13肽可以天然地靶向菌株当中的菌株RNA。它可以对细胞内进行时面向对象，从菌株粒状当中转换成特定的丝氨酸核酸。尽管CRISPR Cas13系统对仍然长期存在一些在实践中，但是该方法在试验室当中易于操控，并且早先张锋小组的数据分析执法人员在哺乳动物细胞膜当中已经进行时了充分的试验表明。数据分析执法人员开发了一种名为CARVER的新型和平台，它能将Cas13介导的菌株RNA硫化与基于Cas13的较快病患量度紧密结合起来，采用特定的高灵敏度肽分析报告分子新增（SHERLOCK）和平台，监测粉碎基于RNA的菌株。创始三合一的系统对数据分析执法人员首先比对了350多个人类文明相关菌株（HAV）真核生物，以检验Cas13可以有效地靶向的菌株RNA核酸。他们主要追寻的是既不易突变，又最有有可能在切割后禁用菌株的片段。菌株真核生物当中潜在的Cas13要能残基哈佛大学Cameron Sabeti试验室的耶鲁大学后Myhrvold耶鲁大学对此：“理论上，你可以面向对象Cas13来攻击菌株的任何均。但是亚种内部和亚种中间都有巨大的多样官能，随着菌株的进化，以外真核生物都发生了进一步的波动。如果你不用力，你有可能会追求最后从未效果的要能。”然后，他们通过计算分析测序数据，以确定数百种菌株亚种当中的数千个潜在残基，这些残基有可能是Cas13的有效地遗传物质。月里，数据分析执法人员设计了该系统对的Cas13聘请RNA。新面向对象的Cas13在感染了淋巴细胞膜官能脉络膜脑膜炎菌株（LCMV）、甲型菌株（IAV）和粘液官能口炎菌株（VSV）的人类文明细胞膜当中进行时了试验检测。将Cas13过渡到电子束后24小时，数据分析执法人员观察到培养借助于来物当中菌株RNA的高水平降低了40倍。随后，数据分析执法人员检查了Cas1抑制HIV官能的能力。数据分析数据显示：菌株曝露后八小时，Cas13将菌株的魅力降低了300倍以上。最后，该小组采用SHERLOCK监测技术来实时测量Cas13靶向后的菌株RNA高水平。该监测系统对提供了有关治果的较快反馈以及有关特定菌株突变的信息。简述对于HIV的化疗，虽然已经核准了90多种抗病物，但它们只能化疗9种营养不良。总体而言，只有16种菌株具FDA核准的接种。因此，寻觅不断改进的抗菌株方法显得尤为重要。该数据分析的第一作者 Catherine Freije 对此：“Cas13可以是一种数据分析工具，来探险人类文明细胞膜当中菌株生物学的许多方面，它也有可能是一种针灸工具，用于病患试样，化疗HIV，并衡量化疗的有效地官能——所有这些都能让CARVER在原先或冠心病菌株借助于现时进一步充分利用和应对。”