Science:从线粒体层面解析为何“**有别”

2021-10-13 14:08:04 来源:
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已有的深入研究显示,许多复杂的进化一般说来,包括性疾病,都发挥出有个体差异的也就是说特征。这些个体差异被不同往往地归因于皮质醇、子代、等位等位基因×性别角色效应、道德上差异和环境暴露的差异。然而,至今为止,它们的必要和也就是说分子生物学原理在来得大往往上也就是说上是确实的。

等位等位基因-有分组织隐含(GTEx)计划提供了一个机会,让我们可以通过深入研究许多以前未曾以这种方式并不一定的有分组织,来探究进化mRNA分组里个体差异的普遍性和基因型必要。

最近,深入研究技术人员在Science杂志发文。为了并不一定进化mRNA分组及其依赖性的个体差异,并发现性别角色和生态学如何最常为互直接影响复杂的等位基因和性疾病,深入研究技术人员在GTEx计划(v8数据集发布)调查的44个进化有分组织是从里作用于了等位基因隐含及其基因型依赖性的个体差异目录,并系统性了16245个RNA测序样本和838个刚出生个体的等位等位基因。

在此基础上,深入研究技术人员报告了等位基因隐含水平、有分组织细胞类型分组成和官能团隐含定量等位基因基因座(cis-eQTLs)的个体差异。为了评估它们的直接影响,深入研究技术人员将这些结果与87个GWAS的等位基因功能、mRNA因子结合注释和全线粒体最常为似之处深入研究(GWAS)核心内容统计最常为结合。

最近,性别角色对等位基因隐含的直接影响是无处不在的 (在所有有分组织里,深入研究技术人员断定了13 294个有个体差异的等位基因)。然而,这些直接影响较大,而且主要是有分组织甲基化的。

带有个体差异隐含的等位基因主要不是由有分组织甲基化等位基因隐含飞轮的,而是策划了一系列独特的生物功能,如药物和激素化学反应、胚胎发育和有分组织形态发生、受精、性生殖和精子发生、脂肪代谢、白血病和免疫化学反应等。

而X连接等位基因在未婚里隐含较高,提示了逃避X等位基因失活的候选等位基因,最常等位基因等位基因的性别角色偏向性隐含提示了与激素最常为关的mRNA因子依赖性和额外mRNA因子的起着,以及一般说来生态学标记的个体差异性分布,引人注意是分组蛋白H3 Lys27三磷酸化(H3K27me3)。

等位基因隐含的基因型依赖性的个体差异要少得多(在所有有分组织里断定出有了369个性别角色偏向的eQTL),并且带有高度的有分组织甲基化。深入研究技术人员发现了58个由单一性别角色的等位基因隐含基因型依赖性飞轮的等位基因-等位基因最常为似之处。这些包括个体差异的细胞类型丰度介导等位等位基因-一般说来最常为似之处的基因座,以及性别角色可能在最常为似之处的潜在分子必要里发挥来得这样一来起着的基因座。例如,深入研究技术人员在血液里发现了一个未婚甲基化的六激酶HKDC1的eQTL,它直接影响怀孕未婚的糖类代谢,随后说明了在后裔的出有生体重上。

因此,通过将GTEx数据集的性别角色观念系统性与等位基因功能和mRNA因子结合注释最常为联合,深入研究技术人员说明了了导致进化mRNA分组和eQTLs个体差异的有分组织甲基化和有分组织共享的飞轮考量和必要。

深入研究技术人员发现了多个个体差异的等位基因隐含效应,这些效应与复杂的等位基因基因型最常为似之处共轭,从而作出贡献了GWAS信号的机理解释。

由于许多一般说来的致病有分组织是确实的,因此对独特的GTEx有分组织收集的系统性可以作为调查性别角色偏倚等位基因基础的强大资源。这项工作对进化mRNA分组的个体差异及其基因型依赖性开展了广泛的并不一定。

原始出有处:

Meritxell Oliva et al. The impact of sex on gene expression across human tissues. Science (2020). DOI: 10.1126/science.aba3066

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