2021年结帕金森氏症分子检测高通量测序中国专家共识发布，要点一览！

珠肝癌在我国的发病率呈逐年持续上升的21世纪，世 界卫生该组织国际癌症研究工作政府机构(International Agency for Research on Cancer，IARC)数据资料显示，我国 2020 年珠直 病情严重的新发个案数为 56 万例，因珠肝癌死亡个案达 29 万例 。 达 25%的珠肝癌病患者在病患时已浮现远 处移转到，此之外，25%的病患者在治疗法检视过程中的频发移转到，晚期 病患者预后很低，5 年生存率不足 15%。 分子标志物仍须 校正是挑选凋亡治疗法获益人群的前和安，近些年随着样品 新科技的飞速发展，很数据检视脱氧核糖脱氧核糖核酸，也称为下一代脱氧核糖脱氧核糖核酸( next generation sequencing，NGS)，因其在辐射能、再加本及效率 等方面的总合优势，在遗传特异开放性样品中的展现出越 来越广阔的应该用前景。 然而 NGS 样品新科技检视检视过程复杂， 对仍须验房环境有条件、人员能力及运动速度管理者决定很高，任何 一个环节浮现疑问，均会影响样品珠果的准确开放性，进而影响药理学决策。

为情况下药理学诊疗工作的准确开放性和标准化开放性，本互信由药理学医师珠合珠肝癌实际诊疗需求筹划，业内诸多样品新公司参与，病理及仍须验专业人士所称导，从珠肝癌 NGS 样品的药理学角度及仍须验房检视检视过程质控角度共同起草中的国专业人士互信，以所称导 NGS 样品新科技在珠肝癌诊疗中的的标准化应该用。

1，海洋生物标志物在珠肝癌中的的药理学本质

目前较恰当的病情严重之之外遗传开放性传染病主要有 3 类:Lynch 症、家族开放性腺瘤肉病 ( familial adenomatous polyposis，FAP）和黑斑水肿病（P⁃J 症）。 同时《中的国药理学学会 ( CSCO) 珠肝癌诊疗最新 2020 国际版》 针对遗传开放性珠肝癌筛查和遗传病患制定了法理。

FAP 和安拔进行时 APC 内含子脱氧核糖脱氧核糖核酸/完整版缺失脱氧核糖脱氧核糖核酸，有特异开放性和安示 FAP 或衰减改型 FAP(AFAP);无特异开放性 则和安拔行 MUTYH 内含子脱氧核糖脱氧核糖核酸 / 完整版缺失脱氧核糖脱氧核糖核酸，有突 坏和安示 MUTYH 之之外水肿病(MUTYH⁃associated pol⁃ yposis，MAP)。 对于无任何已知的水肿病症遗传 的细菌感染开放性人体内，正因如此多遗传特异开放性样品，多遗传 Panel 应该都有所有水肿和珠肝癌之之外遗传。

珠肝癌中的罕见 TMB 可用作法及样品范围简介

TMB 样品有助于协助挑选无故疫治疗法潜在获 益的病患者，明显和安升晚期恶开放性病患者的客观缓 解率和总生存期。 MSI⁃H/dMMR 一般来说也随之而来 TMB⁃H，MSI⁃H 珠果显示中的有达 83%展现为 TMB⁃H，且有 97%的珠果显示 TMB≥10 Muts/ Mb。 在药理学研究工作和系统化检视过程中的，TMB 的审计可用标准标准化 在不同癌种中的普遍存在差别，而不同凋亡脱氧核糖脱氧核糖核酸 Panel 的 TMB 样品体系之间 TMB 阈值不能国际标准标准化。

病患者制定之之外治疗法方案的检视过程，珠合珠肝癌海洋生物标志物之之外药理学本质，新要求样品作如下和安拔 ：

2，珠果显示检视及船运

FFPE 珠果显示为情况下脱氧核糖核酸运动速度，移植手术或活仍须

该组织应该在离体 30 min 内浸入到 100 ml 的 4%甲 酮溶液中的进行时一般来说，遇无故用到酸开放性及含有金属乐 氢离子的一般来说液。 其中的，大标本一般来说一段时间为 6 ~ 48 h，不超过 72 h;小活仍须体可一般来说 6 ~ 12 h。 对 其中的 1 张 FFPE 珠果显示进行时切片染，并在成像 下观察细胞会的含量比和数量。 若含量比不 足，则仍须验房只能对通过硫化物后符合运动速度决定的 标本进行时审计，或者制备再加 FFPE 细胞会学蜡块后 进行时脱氧核糖核酸和安取。 值得注意的是，积极开展 NGS 样品前 应该通过 HE 染审计细胞会含量比，至少满足肿 瘤细胞会含量比在 20%以上。

移植手术或活仍须的可口该组织珠果显示

可口该组织可和安取到很高运动速度的脱氧核糖核酸。 可口该组织应该在离体 30 min 内 将其遗留于液氮盛载或者-80 °C 冰冻木箱中的，防止 RNA 等 脱氧核糖核酸降解。 如需审计细胞会含量比，可先为用冷藏切 片线粒体作法，若细胞会含量比不足，可通过标记 区域进行时硫化物。 可口该组织可在液氮、-80 °C 冰冻 木箱或洗涤剂中的长期遗留。

大便液珠果显示

对于普遍存在于大便液中的的循环系统 DNA， 即 ctDNA，样本时可用到专用的 ctDNA 遗留管先为血， 先为血后轻柔反转 8 ~ 10 次，确保先为血管中的的 ctDNA 遗留液与大便液充分混匀，甲酮船运遗留只需，禁止 冻融大便液;到达仍须验房后，分离大便液，和安取可溶 DNA[26] 。 也可用到一次开放性 EDTA 抗凝高热先为血管， 先为集 8 ~ 10 ml 全血，冷藏交通运输，2 h 内分离大便液，和安 取可溶 DNA，如需遗留，请摆在-80 °C 冰冻木箱中的，并遇 无故一再冻融。

珠果显示搬运标准化

还给标准标准化操作标准化( SOPs) 以确保搬运检视过程中的各类样 本的安全开放性和检视过程的可控开放性(详见第 4 节)。 石蜡 材料可以甲酮交通运输，大便液珠果显示只能在冰冻冻有条件下运 输，脱氧核糖核酸珠果显示需在 4 °C或冷藏有条件下交通运输。

3，份副本探究及标准标准化示例

NGS 药理学份副本包含内容

遗传样品的药理学报 告应该当都有:(1)基础的资讯:仍须验房名字、仍须验操 作人员、份副本审计人员、简历。 (2)受仍须者的 大体上的资讯:应该都有受仍须者姓名、开放性别、出生定于、 遵从样品的定于、样品的目的和受仍须者的药理学所称 征等。 (3)珠果显示的的资讯:珠果显示类改型，如 DNA、之外周血、唾液、可口该组织、FFPE 该组织等;先为集一段时间和先为 集部位、珠果显示N、还给仍须一段时间、样品份副本一段时间和样 本主要质控情况，如 DNA 运动速度审计以及脱氧核糖脱氧核糖核酸质 量审计等。 (4)样品项目:遗传 Panel 的样品位 点及 仍须 校正 范 围、 仍须 校正 明为 容器、 仍须 校正 试 剂， 是 否 为 NMPA 批准用到的样品试剂以及 NMPA 获批的 遗传肽链的资讯，或仍须验房自新建样品( laboratory de⁃ veloped tests，LDTs) 试剂、样品作法、样品范围、仍须 校正等于(LoD)等。 (5)样品珠果及人体内探究:对 遗传人体内的样品珠果进行时探究，如仍须出的遗传 改型、人体内珠果、线粒体坏化情况、样品珠果的细菌感染 开放性PG、药物的资讯及药理学本质、人体内探究引用的 参看手抄本等。 (6)标注样品作法的仍须验房实质上验 证珠果，样品局限及不确定开放性，全面性样品的 新要求。

遗传人体内的定名

对遗传人体内的描绘应该遵循 一定的法理和标准化，和安拔用到人类遗传组人体内协会 定名最新(www.hgvs.org)，核苷酸本的选择新要求先为用遗传座参看遗传组序列元数据资料( Locus Reference Ge⁃ nomic， https:/ /www.lrg⁃sequence.org) 界定的核苷酸本或者多个国际元数据资料算是的主要核苷酸本。 对遗传开放性珠肝癌之之外遗传人体内的说明，新要求以澳大利亚外科遗传学学院( American College of Medical Genetics and Genomics，ACMG;https:/ / www.acmg.net)最新为标准标准化，在样品珠果中的参见具体的人体内肽链的资讯，都有遗传名字、所参看的人类遗传组国际版本号、核苷酸本参看序列国际版本号、核苷酸人体内、人体内、内含子 / 内含子序号、性状杂合开放性、线粒体N及投影等等。

药理学本质的探究和批注

对于卵子特异开放性，先为用PG检视的方式 总合随之而来病患、药理学最新、元数据资料或手抄本论据，可 以将卵子遗传特异开放性分为药理学本质恰当(I 级)、有潜在药理学本质(II级)、药理学本质不恰当(III 级) 和良开放性或显然良开放性特异开放性( IV级) 。 仍须验房只能新建立分类及PG和份副本的 SOPs，SOPs 应该至少都有两 个方面:(1) 对卵子遗传特异开放性进行时PG的检视检视过程; (2)在日常样品中的份副本哪一级或哪几级特异开放性肽链。 PG的检视检视过程应该有详细描绘，都有论据来源的最新、手抄本、 元数据资料、论据类别、PG珠果等。 药理学论据不得不突 坏肽链PG，可根据《很数据检视脱氧核糖脱氧核糖核酸新科技药理学标准化化 应该用北京专业人士互信》发表的卵子特异开放性肽链和临 床论据分为以下 4 级。

对胚系特异开放性的样品

除了中的之外诊疗最新及 重要参看手抄本之外，则有 Online Mendelian Inheritance in Man (http:/ /omim.org)和澳大利亚 ACMG 可参看。 ACMG 最新将人体内肽链细菌感染开放性的类别分为细菌感染、疑 似细菌感染、药理学本质未明、疑似良开放性和良开放性 5 个类别。 份副本中的应该参见与遗传开放性珠肝癌(如 FAP、Lynch 先为 合征等)之之外的细菌感染以及疑似细菌感染人体内，并对人体内 的细菌感染开放性进行时分析探究[28] 。

本质不明肽链的检视

无论是卵子 特异开放性，或是胚系特异开放性，都普遍存在本质不明肽链。 仍须验 房需制定之之外政策用来确定确实份副本或者不份副本 药理学本质不明的肽链，并附上说明和参看元数据资料， 并且要在份副本中的注明本仍须验房出具药理学份副本的 规则。

DPYD 样品珠果

中的等激素改型病患者，应该基于 活开放性分值降低起始施打;慢激素改型应该遇无故用到氟大便嘧 啶及其前体药物。 UGT1A1 样品珠果中的，UGT1A1∗28 和∗6 为纯合人体内改型或双杂合人体内改型的病患者应该降低 伊立替康的施打，和安拔施打为 150 mg / m2 。

低总质量特异开放性珠果的检视

对珠果显示进行时 NGS 仍须 校正时如浮现高总质量的特异开放性珠果( 一般来说该组织学珠果显示略高于 5%，大便液珠果显示略高于 1%或略高于样品 LoD)时，新建 议总合审计 NGS 仍须验平台开放性能、脱氧核糖脱氧核糖核酸深度以及 细胞会比例等因素总合再考虑。 特别对于凋亡治疗法都与 关的遗传新要求用到其他样品作法进行时全面性验证 确认(如 Sanger，dPCR 等)。

告知不得不

新要求和安供病患者文稿或者在线国际版的告知书。

份副本示例

仍须验房应该根据样品项目，得出结论对应该 的样品份副本示例(表 7)，并形再加 SOP 副本。 示例中的 应该恰当参见样品份副本中的应该和安供的的资讯，如病患者大体上 的资讯、珠果显示的资讯、样品的资讯、样品珠果、珠果阐释、实 验房的资讯、样品作法的局限以及其他内容等。

原始中有

中的国抗癌协会凋亡治疗法专业委员会.珠肝癌分子样品很数据检视脱氧核糖脱氧核糖核酸中的国专业人士互信 .药理学学刊物 2021 年 3 同年第 26 卷第 3 期 Chinese Clinical Oncology，Mar. 2021，Vol.26，No.3